MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187126	C	14	14	1	14	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NT_187126	C	9	9	16	24	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NT_187126	ATC	2	6	31	36	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NT_187126	CGC	2	6	57	62	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NT_187126	TCG	2	6	65	70	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187126	CAT	3	9	81	89	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187126	CGC	2	6	90	95	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NT_187126	ATC	2	6	97	102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187126	CGC	2	6	123	128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NT_187126	GCC	2	6	151	156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NT_187126	TCG	2	6	158	163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NT_187126	CGC	2	6	177	182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NT_187126	G	7	7	197	203	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187126	GCA	2	6	269	274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NT_187126	CGC	2	6	276	281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NT_187126	TTAA	2	8	495	502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187126	TAT	2	6	632	637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187126	TGAA	2	8	646	653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187126	ATT	2	6	694	699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187126	TTTA	2	8	719	726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187126	AAT	2	6	758	763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187126	A	6	6	3033	3038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187126	A	7	7	3040	3046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NT_187126	GCC	2	6	3077	3082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NT_187126	A	6	6	3161	3166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NT_187126	AGG	2	6	6273	6278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187126	ATT	2	6	7643	7648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187126	T	6	6	7671	7676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187126	CAT	2	6	7693	7698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187126	CGT	2	6	7719	7724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187126	CTGGC	2	10	7766	7775	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NT_187126	CT	3	6	7818	7823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NT_187126	GCC	2	6	9303	9308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NT_187126	T	6	6	9894	9899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187126	GGT	2	6	9946	9951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187126	CAAA	2	8	13311	13318	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NT_187126	GT	3	6	14185	14190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187126	TGT	2	6	14242	14247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187126	GGC	2	6	14714	14719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187126	TAA	2	6	15688	15693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187126	TTG	2	6	17770	17775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187126	GC	3	6	17797	17802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NT_187126	CCG	2	6	19861	19866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NT_187126	ACA	2	6	19892	19897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NT_187126	GCC	2	6	19919	19924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NT_187126	TC	3	6	19945	19950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NT_187126	GCG	2	6	19962	19967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187126	GAA	2	6	20021	20026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187126	AAC	2	6	20045	20050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NT_187126	GTT	2	6	20648	20653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187126	CGG	2	6	20662	20667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187126	GGC	2	6	20669	20674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187126	GCC	2	6	20685	20690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NT_187126	CGT	2	6	20804	20809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187126	GCG	2	6	20864	20869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NT_187126	TCGGCG	2	12	20878	20889	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187126	GCG	2	6	20910	20915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NT_187126	ATT	2	6	20927	20932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187126	T	7	7	22648	22654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187126	TTC	2	6	22704	22709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NT_187126	CGT	2	6	23323	23328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NT_187126	GCC	2	6	23410	23415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NT_187126	TAT	2	6	23441	23446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187126	ATC	2	6	23461	23466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187126	A	7	7	23473	23479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187126	T	8	8	23495	23502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187126	TGT	2	6	23740	23745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187126	CGG	2	6	23752	23757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187126	ATA	2	6	23843	23848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187126	CTT	2	6	23894	23899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187126	GCC	2	6	24773	24778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NT_187126	GCG	2	6	24789	24794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NT_187126	T	8	8	24796	24803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187126	AT	3	6	24815	24820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187126	ATTTG	2	10	24832	24841	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187126	TTAAT	2	10	24961	24970	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187126	AAT	2	6	24981	24986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187126	T	8	8	25031	25038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187126	TG	3	6	26866	26871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187126	TTA	2	6	26880	26885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187126	TAAG	2	8	27311	27318	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187126	AAACT	2	10	27342	27351	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NT_187126	AAC	2	6	27378	27383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NT_187126	GGCG	2	8	27889	27896	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NT_187126	TAACT	2	10	27922	27931	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NT_187126	CT	3	6	30106	30111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NT_187126	CAT	2	6	31370	31375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NT_187126	TCA	2	6	31415	31420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NT_187126	GGTT	2	8	31553	31560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187126	A	6	6	32503	32508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187126	CTT	2	6	32611	32616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NT_187126	TAC	2	6	32625	32630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187126	GCA	2	6	33880	33885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187126	GCA	2	6	33888	33893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187126	AGTG	2	8	33894	33901	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187126	AGAA	2	8	33983	33990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187126	ATT	2	6	34090	34095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187126	T	6	6	34094	34099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187126	AGTGA	2	10	34153	34162	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187126	ACT	2	6	35242	35247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NT_187126	CGA	2	6	35275	35280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NT_187126	CAA	2	6	35381	35386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NT_187126	GAAA	2	8	43861	43868	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187126	ATT	2	6	43878	43883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187126	A	6	6	43922	43927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187126	T	6	6	43955	43960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187126	TA	4	8	43975	43982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187126	TATT	3	12	44005	44016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187126	TTA	3	9	44020	44028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187126	TTC	2	6	44044	44049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187126	A	6	6	44073	44078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187126	TATTT	2	10	44083	44092	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187126	GTT	2	6	44611	44616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187126	TTTG	2	8	44668	44675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187126	TTA	2	6	44679	44684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187126	ATG	2	6	44699	44704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187126	AATAAA	2	12	44715	44726	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187126	TAA	2	6	44729	44734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187126	ATT	2	6	44735	44740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187126	TCC	2	6	44774	44779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NT_187126	A	6	6	44828	44833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NT_187126	TAA	2	6	44841	44846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187126	TCA	2	6	44847	44852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187126	AAGT	2	8	44869	44876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187126	AAT	2	6	45916	45921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187126	A	6	6	45971	45976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187126	CTA	2	6	45997	46002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187126	A	7	7	46044	46050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187126	TCGT	2	8	46092	46099	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NT_187126	A	6	6	51502	51507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187126	GAC	2	6	51527	51532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NT_187126	GCC	2	6	51553	51558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NT_187126	GCA	3	9	51566	51574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187126	ACTT	2	8	51711	51718	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NT_187126	GCC	2	6	51747	51752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NT_187126	GCT	2	6	52369	52374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NT_187126	AAT	2	6	52390	52395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187126	AAC	2	6	52399	52404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NT_187126	C	6	6	55683	55688	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
140	NT_187126	A	7	7	55712	55718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187126	GTTT	2	8	56048	56055	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187126	TAAG	2	8	56081	56088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187126	GCC	2	6	56811	56816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NT_187126	CT	4	8	57317	57324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NT_187126	GGC	2	6	57381	57386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NT_187126	CG	3	6	57467	57472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NT_187126	GAA	2	6	57485	57490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187126	TAAG	2	8	57507	57514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NT_187126	AG	3	6	63189	63194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NT_187126	GCG	2	6	63255	63260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NT_187126	GCA	2	6	63433	63438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NT_187126	CAG	2	6	63473	63478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.